Η Εθνική Αρχή Ηλεκτρονικής Υγείας έχει ως αποστολή να μεριμνήσει για την πραγμάτωση του πιο πάνω οράματος με την ενσωμάτωση και ευθυγράμμιση της ηλεκτρονικής υγείας με τους εθνικούς στρατηγικούς στόχους της πολιτικής για την υγεία. Η ηλεκτρονική υγεία δεν πρέπει να είναι ο στόχος μιας αυτόνομης στρατηγικής, αλλά να είναι πλήρως ενσωματωμένη στη συνολική πολιτική για την υγεία. Για παράδειγμα, οι πολιτικές προτεραιότητες που αφορούν την υγεία και την κοινωνία πρέπει να καθοδηγούν την περαιτέρω ανάπτυξη του τομέα της ηλεκτρονικής υγείας τόσο σε εθνικό επίπεδο όσο και σε ολόκληρη την Ευρώπη και τα διασυνοριακά συμβαλλόμενα με αυτήν κράτη.